Para obtener una muestra representativa de la microbiota del suelo en tu finca, es necesario recolectar muestras de distintas áreas. Para ello, se utilizan herramientas como palas, azadas o cubetas.
Para obtener una muestra representativa de la microbiota del suelo en tu finca, es necesario recolectar muestras de distintas áreas. Para ello, se utilizan herramientas como palas, azadas o cubetas.
1.Recolección de
muestras de suelo
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Figura 1: Agropecuario y exposición.
Para garantizar unos buenos resultados se deben seguir
unos pasos los cuales son: Selección de puntos: Tomando muestras en diferentes áreas
de la finca (Zonas fértiles, degradadas, cerca de cultivos y demás). En la
profundidad que se debe extraer suelo de 5 a 20 cm de profundidad. Una cantidad
de al menos 200-500 g de suelo por muestra. Se debe almacenar en bolsas
estériles y refrigera las muestras si no las procesarás de inmediato. Es
importante identificar el predio mediante un croquis que contemple aspectos
como la pendiente, los cultivos presentes, la textura del suelo, las prácticas
de laboreo y el drenaje. Durante la recolección, se toman varias submuestras de
suelo, evitando los bordes del terreno. Luego, el suelo se deposita en una
bolsa o balde limpio, donde se deshacen los agregados hasta alcanzar un tamaño
aproximado de 1 cm. Finalmente, la muestra se mezcla de manera uniforme para
asegurar su representatividad
2. Cultivo y
aislamiento de microorganismos
Aislamiento de Microorganismos: Para aislar hongos y
bacterias presentes en el suelo, se emplean técnicas como la dilución en placa
o métodos de filtración. El proceso comienza con la recolección, conservación y
transporte adecuado de las muestras. Posteriormente, estas se examinan con un
microscopio para evaluar su contenido microbiano.
Las muestras se siembran en medios de cultivo apropiados
y bajo condiciones óptimas para favorecer el crecimiento de microorganismos. A
medida que las colonias se desarrollan, se observan y analizan sus
características. Finalmente, se aíslan las colonias individuales con el
objetivo de obtener cultivos puros para su estudio detallado.
Aislamiento de
bacterias
Figura 2
Fuente: Pinterest (Cultivo de bacterias en platos de petri en el laboratorio)
Enlace: https://pin.it/Vp6cDw4b1
Se debe de realizar el siguiente procedimiento
1. Preparación de diluciones seriadas:
Mezcla 10 g de suelo con 90 ml de agua estéril.
Realiza diluciones en serie (1:10 hasta 1:1000).
2. Siembra en medios selectivos:
Agar nutritivo: Para bacterias heterotróficas en general.
Agar TSA (Tripticase Soy Agar): Para bacterias del suelo
comunes.
Agar King B: Para bacterias fluorescentes (Pseudomonas).
3. Incubación: A 28-30°C por 24-48 horas.
Identificación de
Hongos
Para identificar hongos, se utilizan técnicas como la
siembra en medios de cultivo selectivos y diferenciadores. Además, se analizan
las características macroscópicas y microscópicas de las colonias fúngicas,
permitiendo su clasificación y estudio detallado.
Aislamiento de
hongos
Figura 3
Fuente: Pinterest
Enlace:https://pin.it/2kxYCkDvT
1. Siembra directa de suelo en medios específicos:
Agar Sabouraud: Para hongos filamentosos y levaduras.
Agar PDA (Papa Dextrosa): Para hongos patógenos y
saprófitos.
2. Incubación: A 25-28°C por 3 a 7 días.
3. Identificación macroscópica y microscópica
Bacterias: Observa el color, forma y textura de las
colonias. Usa tinción de Gram para diferenciarlas.
Hongos: Examina la morfología de las colonias y estructuras
microscópicas con un microscopio óptico.
4. Métodos moleculares para análisis avanzado
Si buscas una identificación más precisa, puedes emplear
técnicas como:
Extracción de ADN: Usa kits comerciales o el método CTAB.
PCR y secuenciación:
Para bacterias: Amplificación del gen 16S rRNA.
Para hongos: Amplificación del ITS (Internal Transcribed
Spacer).
Metagenómica: Permite analizar toda la diversidad
microbiana sin necesidad de cultivo.
Análisis
Molecular
Fuente: You Tube Autor Dante BioTec (11 de Marzo 2021)
Enlace: https://youtu.be/MSn72af7Jmc?si=MSPYTL3_O3cB7BzK
Para una identificación más precisa de hongos y
bacterias, se emplean técnicas basadas en el análisis del ADN. Entre estos
métodos destacan la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), la secuenciación
de ADN y la espectrometría de masas MALDI-TOF, que permiten determinar con
exactitud las especies presentes en una muestra.
Interpretación de
Resultados
El análisis de los resultados se centra en evaluar la
diversidad y abundancia de hongos y bacterias presentes en el suelo, teniendo
en cuenta los factores ambientales que pueden influir en la microbiota. Dado
que el estudio de la microbiota del suelo requiere conocimientos especializados,
es recomendable contar con la asesoría de expertos en microbiología del suelo
para una interpretación más precisa y útil.
Hongos y Bacterias, Microorganismos Clave para el
Rendimiento de los Cultivos Agrícolas
Agencia SINC. (2023). Hongos y bacterias, microorganismos
clave para el rendimiento de los cultivos agrícolas. Recuperado de
Guía de Muestreo de Suelo para Análisis Microbiológico
Cely, P., & Balaguera-López, H. E. (2020). Guía de
muestreo de suelo para análisis microbiológico.
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